52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4962 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  717    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  76.59 
 
 		 346 aa  561  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  66.57 
 
 		 348 aa  484  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  58.84 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  59.54 
 
 		 346 aa  431  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  58.4 
 
 		 351 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  49.71 
 
 		 356 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  45.56 
 
 		 344 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  43.27 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  43.27 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  42.34 
 
 		 357 aa  275  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  40.98 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  42.9 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  42.25 
 
 		 371 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  38.33 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  39.44 
 
 		 382 aa  179  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  37.18 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  36.92 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  36.92 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  37.6 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  33.85 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  38.57 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  38.84 
 
 		 387 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  38.61 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  38.57 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  35.13 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  37.05 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  36.15 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  36.13 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  36.67 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  33.93 
 
 		 386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  30 
 
 		 475 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  32.01 
 
 		 408 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  34.3 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  32.36 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  32.03 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  29.86 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  30 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  28.65 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  31.85 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  26.5 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  24.44 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  26.73 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  26.55 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  28.09 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  27.74 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  28.72 
 
 		 464 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  30.41 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  36.05 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  29.71 
 
 		 549 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  29.46 
 
 		 441 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  37.65 
 
 		 468 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>