70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2624 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  956    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  35.4 
 
 		 387 aa  223  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  34.1 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  36.12 
 
 		 382 aa  216  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  34.96 
 
 		 379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  34.33 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  34.23 
 
 		 380 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  35.48 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  35.48 
 
 		 387 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  34.95 
 
 		 383 aa  207  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  35.48 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  33.67 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  35.31 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  33.51 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  35.04 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  35.04 
 
 		 387 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  35.04 
 
 		 387 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  33.99 
 
 		 346 aa  192  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  33.24 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  32.45 
 
 		 390 aa  157  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  32.65 
 
 		 408 aa  151  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  28.87 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  29.84 
 
 		 418 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  28.42 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  30.23 
 
 		 346 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  34.46 
 
 		 360 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  30.48 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  29.11 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  29.04 
 
 		 344 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  32.47 
 
 		 360 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  29.54 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  29.86 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  27.39 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  28.64 
 
 		 346 aa  107  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  32.65 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  27.55 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  31.92 
 
 		 357 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  30.48 
 
 		 354 aa  96.3  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  26.81 
 
 		 365 aa  93.6  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  24.89 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  29.51 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  27.93 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  25.91 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  25.42 
 
 		 549 aa  73.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  25.93 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  25.75 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  25.9 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  25.06 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  27.21 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  23.53 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  34.36 
 
 		 441 aa  53.5  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  32.23 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4828  hypothetical protein  24.59 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  25.25 
 
 		 386 aa  50.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  21.97 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  25.86 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  23.42 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  23.82 
 
 		 491 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  21.5 
 
 		 550 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  28.17 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  24.87 
 
 		 559 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  24.62 
 
 		 551 aa  47.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  24.43 
 
 		 506 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  23 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  22.78 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  27.73 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  25.98 
 
 		 593 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  23.29 
 
 		 533 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  23.08 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  24.19 
 
 		 522 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>