48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4728 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  958    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  26.76 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  28.13 
 
 		 408 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  29.52 
 
 		 390 aa  136  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  27.2 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  27.88 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  24.03 
 
 		 560 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  24.85 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  27.34 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  28.35 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  25.45 
 
 		 346 aa  94.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  28.66 
 
 		 380 aa  93.2  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  28.71 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  27.7 
 
 		 387 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  27.34 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  24.54 
 
 		 475 aa  91.3  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  27.34 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  27.34 
 
 		 387 aa  90.1  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  25.88 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  26.47 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  29.88 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  26.1 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  26.1 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  25.41 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  28.57 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  24.58 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  29.05 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  25.07 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  24.04 
 
 		 386 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  27.76 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  27.9 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  25.91 
 
 		 470 aa  67  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  24.58 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  29.35 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  27.13 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  28.72 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  23.68 
 
 		 343 aa  57  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  26.79 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  29.6 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  23.68 
 
 		 343 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  23.61 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  25.82 
 
 		 360 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  27.16 
 
 		 362 aa  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  28.04 
 
 		 357 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  24.89 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4828  hypothetical protein  24.92 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  25.35 
 
 		 360 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  25.99 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>