61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3418 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  722    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  69.8 
 
 		 346 aa  511  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  69.8 
 
 		 346 aa  511  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  58.4 
 
 		 352 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  56.45 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  52.71 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  50.3 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  46.8 
 
 		 356 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  41.76 
 
 		 357 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  42.65 
 
 		 362 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  41.59 
 
 		 354 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  40.96 
 
 		 371 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  40.41 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  40.12 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  37.82 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  37.82 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  37.56 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  37.7 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  37.6 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  37.6 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  37.71 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  36.03 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  37.6 
 
 		 387 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  36.95 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  35.75 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  36.52 
 
 		 380 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  34.11 
 
 		 388 aa  175  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  34.65 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  33.33 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  34.72 
 
 		 379 aa  169  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  37.98 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  32.27 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  34.5 
 
 		 475 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  32.15 
 
 		 408 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  36.65 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  29.88 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  29.86 
 
 		 470 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  28.12 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  28.12 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  27.37 
 
 		 477 aa  87  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  27.57 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  29.04 
 
 		 475 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  25.07 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  27.33 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  23.56 
 
 		 560 aa  73.2  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  35.2 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  28 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  31.87 
 
 		 549 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  23.78 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  29.41 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  29.27 
 
 		 470 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  26.06 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  27.81 
 
 		 516 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  25.95 
 
 		 569 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  32.76 
 
 		 491 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  32.76 
 
 		 491 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  32.76 
 
 		 491 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  31.9 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  31.9 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  31.9 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  31.9 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>