50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1411 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  95 
 
 		 360 aa  711    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  744    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  70.19 
 
 		 371 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  66.57 
 
 		 354 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  64.19 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  68.44 
 
 		 357 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  43.82 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  45 
 
 		 346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  40.54 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  43.27 
 
 		 352 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  42.4 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  40.41 
 
 		 351 aa  256  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  37.27 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  37.57 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  32.7 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  32.95 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  32.66 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  32.22 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  31.12 
 
 		 380 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  32.75 
 
 		 387 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  32.56 
 
 		 387 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  30.53 
 
 		 380 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  32.75 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  28.68 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  32.72 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  34.68 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  32.28 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  31.75 
 
 		 382 aa  135  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  29.8 
 
 		 379 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  32.01 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  32.08 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  35.66 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  30.32 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  32.46 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  34.12 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  30.61 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  30.03 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  29.48 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  26.55 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  29.61 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  25.61 
 
 		 593 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  31.1 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  24.08 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  25.57 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  23.87 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  26.62 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  25.35 
 
 		 464 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  27.14 
 
 		 635 aa  47  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  26.28 
 
 		 560 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  32.28 
 
 		 549 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>