57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3753 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  711    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  51.14 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  49.26 
 
 		 346 aa  348  9e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  50.3 
 
 		 351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  48.75 
 
 		 356 aa  342  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  48.07 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  44.7 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  45.56 
 
 		 352 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  38.96 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  38.05 
 
 		 357 aa  245  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  36.96 
 
 		 362 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  37.27 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  37.53 
 
 		 360 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  37.15 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  35.04 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  36.18 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  37.88 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  37.6 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  35.81 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  36.57 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  35.81 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  35.81 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  35.81 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  34.35 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  34.1 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  35.11 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  35.14 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  36.34 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  33.88 
 
 		 475 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  35.93 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  33.07 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  38.1 
 
 		 390 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  34.08 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  32.35 
 
 		 408 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  34.33 
 
 		 418 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  35.27 
 
 		 365 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  29.26 
 
 		 477 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  28.77 
 
 		 470 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  31.67 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  27.78 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  28.21 
 
 		 386 aa  85.9  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  40.6 
 
 		 433 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  25.72 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  25.41 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  26.9 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  28.48 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  28.04 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  26.32 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  32.28 
 
 		 635 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  32.89 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  29.33 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  32.89 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  27.2 
 
 		 593 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  26.67 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  25 
 
 		 484 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  36.9 
 
 		 448 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  23.1 
 
 		 484 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>