55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2365 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1788  porin  92.25 
 
 		 387 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  91.73 
 
 		 387 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  91.73 
 
 		 387 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  99.22 
 
 		 387 aa  786    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  99.48 
 
 		 387 aa  789    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  791    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  91.99 
 
 		 387 aa  720    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  75.97 
 
 		 383 aa  618  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  71.83 
 
 		 379 aa  594  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  71.83 
 
 		 380 aa  594  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  75.45 
 
 		 382 aa  594  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  73.64 
 
 		 380 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  69.71 
 
 		 387 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  70.26 
 
 		 386 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  47.78 
 
 		 388 aa  358  8e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  46.3 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  37.37 
 
 		 408 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  38.11 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  36.32 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  35.79 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  35.12 
 
 		 475 aa  206  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  35.48 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  37.82 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  34.35 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  37.08 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  36.81 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  36.92 
 
 		 352 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  38.46 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  34.97 
 
 		 346 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  35.47 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  32.46 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  32.74 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  32.39 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  32.95 
 
 		 360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  33.53 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  34.36 
 
 		 362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  32.29 
 
 		 354 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  27.66 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  30.73 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  28.46 
 
 		 477 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  25.59 
 
 		 560 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  29.22 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  27.45 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  30.09 
 
 		 343 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  26.1 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  25.45 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  24.64 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  24.76 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  26.37 
 
 		 593 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  25.61 
 
 		 635 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  24.83 
 
 		 549 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  28.28 
 
 		 585 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  25.71 
 
 		 572 aa  46.2  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  26.83 
 
 		 569 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  33.59 
 
 		 551 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>