56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2599 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  849    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  37.6 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  36.41 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  36.41 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  36.14 
 
 		 387 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  36.14 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  35.61 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  34.95 
 
 		 387 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  34.69 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  34.26 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  35.64 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  35.7 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  34.95 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  35.64 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  35.16 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  34.16 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  34.69 
 
 		 383 aa  189  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  34.07 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  31.4 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  34.21 
 
 		 475 aa  167  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  30.62 
 
 		 348 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  29.75 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  29.84 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  28.87 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  33.69 
 
 		 344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  30.21 
 
 		 346 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  29.16 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  29.25 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  31.67 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  32.27 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  26.81 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  25.13 
 
 		 475 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  29.09 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  32.65 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  27.56 
 
 		 560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  28.74 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  31.29 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  30.03 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  26.24 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  33.05 
 
 		 360 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  31.85 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  28.87 
 
 		 354 aa  90.1  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  25.88 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  38.79 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  28.3 
 
 		 593 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  29.66 
 
 		 635 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  37.82 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  26.17 
 
 		 572 aa  57  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  32.35 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  24.93 
 
 		 351 aa  53.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  34.48 
 
 		 448 aa  53.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  25.28 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  33.99 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  26.43 
 
 		 343 aa  47  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  25.16 
 
 		 549 aa  47  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1498  hypothetical protein  28.66 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0114368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>