35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0526 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  100 
 
 
635 aa  1297    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  34.29 
 
 
585 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  36.36 
 
 
572 aa  274  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  30.42 
 
 
569 aa  274  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  36.08 
 
 
549 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  32.89 
 
 
593 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  32.13 
 
 
551 aa  217  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  29.92 
 
 
418 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  26.83 
 
 
387 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  26.83 
 
 
387 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  26.32 
 
 
380 aa  62.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  24.5 
 
 
388 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  26.83 
 
 
387 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  26.83 
 
 
387 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  25.61 
 
 
387 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  25.61 
 
 
387 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  28.06 
 
 
387 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  25.61 
 
 
387 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  25.51 
 
 
383 aa  56.6  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  25 
 
 
387 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  26.48 
 
 
382 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  24.62 
 
 
390 aa  54.3  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  26.09 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  24.33 
 
 
346 aa  52.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  32.28 
 
 
344 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  27.46 
 
 
356 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  26.72 
 
 
354 aa  48.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  24.9 
 
 
379 aa  47.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  30.07 
 
 
386 aa  47.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  26.52 
 
 
346 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  33.85 
 
 
357 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  26.4 
 
 
371 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  27.14 
 
 
360 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  25.98 
 
 
360 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  25.37 
 
 
475 aa  43.9  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>