30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1995 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1178    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  50 
 
 		 549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  43.51 
 
 		 551 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  34.36 
 
 		 585 aa  292  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  35.37 
 
 		 635 aa  261  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  34.59 
 
 		 593 aa  253  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  32.19 
 
 		 569 aa  249  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  25.85 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  28.9 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  26.17 
 
 		 418 aa  57  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  30.2 
 
 		 448 aa  53.9  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  25.39 
 
 		 382 aa  51.2  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  28.99 
 
 		 452 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  25.07 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  27.27 
 
 		 441 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  26.12 
 
 		 387 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  25.18 
 
 		 388 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  25.2 
 
 		 387 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  25.2 
 
 		 387 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  25.2 
 
 		 387 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  25.2 
 
 		 387 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  25.71 
 
 		 380 aa  47.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  25.71 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  25.71 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  28.11 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  26.45 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  27.53 
 
 		 444 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  34.09 
 
 		 470 aa  44.3  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  26.03 
 
 		 387 aa  43.9  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  27.72 
 
 		 475 aa  43.5  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>