18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2691 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  100 
 
 
585 aa  1213    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  39.41 
 
 
635 aa  320  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  34.72 
 
 
569 aa  307  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  34.36 
 
 
572 aa  306  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  34.12 
 
 
549 aa  295  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  33.69 
 
 
551 aa  267  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  36.85 
 
 
593 aa  258  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  28.69 
 
 
400 aa  55.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  29.39 
 
 
387 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  29.39 
 
 
387 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  29.39 
 
 
387 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  28.46 
 
 
387 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  28.46 
 
 
387 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  28.46 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  28.46 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  28.11 
 
 
379 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  27.46 
 
 
380 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  28.28 
 
 
383 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>