19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3388 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1164    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  34.03 
 
 		 585 aa  296  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  34.81 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  33.55 
 
 		 635 aa  261  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  32.19 
 
 		 572 aa  249  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  34.96 
 
 		 551 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  34.14 
 
 		 593 aa  226  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  28.07 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  26.43 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  26.47 
 
 		 387 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  26.91 
 
 		 387 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  22.38 
 
 		 346 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  26.83 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  26.83 
 
 		 387 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  24.31 
 
 		 400 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  26.91 
 
 		 387 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  26.91 
 
 		 387 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  26.83 
 
 		 387 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  25.95 
 
 		 351 aa  43.5  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>