41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3626 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1229    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  31.34 
 
 		 572 aa  259  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  34.18 
 
 		 549 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  31.2 
 
 		 585 aa  253  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  31.5 
 
 		 569 aa  233  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  32.24 
 
 		 635 aa  223  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  29.93 
 
 		 551 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  27.18 
 
 		 390 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  28.3 
 
 		 418 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  26.69 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  26.71 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  26.62 
 
 		 387 aa  67  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  26.28 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  26.28 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  26.28 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  26.37 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  26.37 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  26.37 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  27.2 
 
 		 388 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  27.49 
 
 		 387 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  27.02 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  26.39 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  26.83 
 
 		 362 aa  60.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  25.58 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  25.99 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  25.77 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  27.87 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  25 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  26.29 
 
 		 380 aa  57  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  24.46 
 
 		 346 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  25.96 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  26.48 
 
 		 380 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  27.66 
 
 		 387 aa  50.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  22.78 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  24.65 
 
 		 357 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  27.15 
 
 		 348 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  27.2 
 
 		 344 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  27.63 
 
 		 346 aa  47.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  26.74 
 
 		 365 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  28.07 
 
 		 343 aa  44.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  23.15 
 
 		 1621 aa  43.5  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>