49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3415 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1123    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  50.17 
 
 		 572 aa  528  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  46.65 
 
 		 551 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  34.76 
 
 		 569 aa  303  7.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  34.93 
 
 		 585 aa  294  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  34.18 
 
 		 593 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  35.94 
 
 		 635 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  28.85 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  27.64 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  26.78 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  27.24 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  26.94 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  31.82 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  26.53 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  26.53 
 
 		 387 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  26.53 
 
 		 387 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  31.87 
 
 		 351 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  24.83 
 
 		 387 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  26.47 
 
 		 390 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  30.47 
 
 		 468 aa  55.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  24.83 
 
 		 387 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  24.53 
 
 		 387 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  30.96 
 
 		 387 aa  54.7  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  25.33 
 
 		 371 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  26.32 
 
 		 475 aa  53.9  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  25.36 
 
 		 470 aa  53.5  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  31.03 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  31.48 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  27.43 
 
 		 450 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  29.27 
 
 		 386 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  30.67 
 
 		 379 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  31.68 
 
 		 346 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  29 
 
 		 441 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  24.91 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  29.2 
 
 		 348 aa  47.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  29.5 
 
 		 448 aa  47  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  24.92 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  24.36 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  28.12 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  28.03 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  31.07 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1456  hypothetical protein  29.95 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  35.78 
 
 		 362 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  29.71 
 
 		 352 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0037  hypothetical protein  28.57 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.434886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  27.87 
 
 		 452 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  32.28 
 
 		 360 aa  43.9  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  25.4 
 
 		 388 aa  43.5  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>