28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3303 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  910    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  75.44 
 
 		 452 aa  717    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  64.49 
 
 		 448 aa  589  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  64.38 
 
 		 441 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  63.84 
 
 		 441 aa  581  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2148  hypothetical protein  62.36 
 
 		 447 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0946706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  26.16 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  25.14 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  36.03 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1859  hypothetical protein  28.4 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1780  hypothetical protein  28.4 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2098  hypothetical protein  27.03 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268023  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  27.14 
 
 		 468 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2049  hypothetical protein  31.61 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1498  hypothetical protein  31.41 
 
 		 409 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0114368  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  30.2 
 
 		 572 aa  53.9  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  34.48 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  22.36 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1456  hypothetical protein  24.37 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  24.09 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  31.5 
 
 		 551 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  28 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0035  hypothetical protein  26.87 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  29.5 
 
 		 549 aa  47  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1440  hypothetical protein  28.33 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0051  hypothetical protein  25.8 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0519  hypothetical protein  27.5 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0828452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  26.63 
 
 		 408 aa  44.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>