14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1498 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1498  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  818    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0114368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2049  hypothetical protein  31.82 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2148  hypothetical protein  28.87 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0946706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  31.95 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  31.06 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  33.56 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  30.41 
 
 		 441 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  29.94 
 
 		 475 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  30.67 
 
 		 448 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  28.57 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  29.87 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  28.77 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  28.66 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  29.87 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>