53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00710 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  788    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  56.43 
 
 		 388 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  48.57 
 
 		 387 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  49.35 
 
 		 379 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  48.7 
 
 		 380 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  49.05 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  48.07 
 
 		 383 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  46.42 
 
 		 387 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  46.15 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  46.15 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  46.13 
 
 		 387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  46.41 
 
 		 387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  46.85 
 
 		 386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  46.13 
 
 		 387 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  46.13 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  46.34 
 
 		 382 aa  315  9e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  37.9 
 
 		 475 aa  262  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  36.6 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  35.63 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  37.01 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  37.43 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  36.36 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  38.68 
 
 		 346 aa  202  9e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  39.02 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  36.48 
 
 		 346 aa  192  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  36.01 
 
 		 351 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  33.24 
 
 		 470 aa  185  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  37.53 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  35.73 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  36.29 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  30.68 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  29.97 
 
 		 475 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  31.69 
 
 		 362 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  30.85 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  32.17 
 
 		 360 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  32.08 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  32.74 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  28.87 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  29.51 
 
 		 354 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  29.34 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  26.11 
 
 		 560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  28.3 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  28.82 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  26.28 
 
 		 343 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  28.31 
 
 		 433 aa  86.3  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  25.31 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  28.88 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  26.03 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  23.45 
 
 		 635 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  27.66 
 
 		 593 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  23.96 
 
 		 491 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4828  hypothetical protein  22.79 
 
 		 420 aa  46.2  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  31.36 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>