73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2915 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  783    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  31.1 
 
 		 488 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  30.96 
 
 		 495 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  30.4 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  29.33 
 
 		 513 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  33.42 
 
 		 447 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  30.83 
 
 		 484 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  28.19 
 
 		 498 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  28.48 
 
 		 516 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  29.55 
 
 		 482 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  28.33 
 
 		 522 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  28.45 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  29.92 
 
 		 488 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  28.89 
 
 		 495 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  29 
 
 		 491 aa  153  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  29.5 
 
 		 531 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  29.19 
 
 		 483 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  28.33 
 
 		 527 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  28.77 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  29.94 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  30.32 
 
 		 561 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  29.28 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  28.9 
 
 		 529 aa  147  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  27.35 
 
 		 553 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  27.05 
 
 		 560 aa  142  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  26.4 
 
 		 565 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  27.79 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  27.79 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  27.31 
 
 		 559 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  26.27 
 
 		 551 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  26.61 
 
 		 553 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  26.97 
 
 		 554 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  26.91 
 
 		 550 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  25.33 
 
 		 533 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  26.36 
 
 		 554 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  31.61 
 
 		 498 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  26.36 
 
 		 502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  27.37 
 
 		 546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  26.91 
 
 		 547 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  26.69 
 
 		 547 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  26.63 
 
 		 497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  27.13 
 
 		 506 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  26.35 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  28.45 
 
 		 521 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  26.83 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  26.35 
 
 		 522 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  24.66 
 
 		 512 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  35.36 
 
 		 347 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  26.48 
 
 		 401 aa  99.4  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  34.24 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  42.2 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  42.2 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  27.62 
 
 		 521 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  41.44 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  27.13 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  28.53 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  41.44 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  38.62 
 
 		 344 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  32.77 
 
 		 345 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  26.37 
 
 		 375 aa  90.9  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  36.99 
 
 		 348 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  39.45 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  38.53 
 
 		 338 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  26.67 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  25.19 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  25.63 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  30.19 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  29.24 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  25.26 
 
 		 477 aa  57  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  25.12 
 
 		 560 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  35.94 
 
 		 119 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  21.31 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  25.25 
 
 		 470 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>