74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4954 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  100 
 
 
565 aa  1136    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  57.7 
 
 
550 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  56.22 
 
 
551 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  55.31 
 
 
531 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  50.35 
 
 
554 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  50 
 
 
554 aa  485  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  49.47 
 
 
559 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  47.71 
 
 
553 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  50.55 
 
 
560 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  48.59 
 
 
553 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  47.71 
 
 
553 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  49.74 
 
 
527 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  49.11 
 
 
522 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  49.82 
 
 
553 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  48.48 
 
 
533 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  47.7 
 
 
547 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  47.52 
 
 
547 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  47.44 
 
 
491 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  49.73 
 
 
546 aa  438  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  34.59 
 
 
513 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  33.39 
 
 
561 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  33.14 
 
 
516 aa  205  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  33.79 
 
 
529 aa  204  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  32.15 
 
 
488 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  31.12 
 
 
491 aa  176  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  29.69 
 
 
502 aa  159  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  29.07 
 
 
495 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  28.9 
 
 
506 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  28.72 
 
 
447 aa  153  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  30.39 
 
 
497 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  28.13 
 
 
522 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  27.38 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  28.3 
 
 
495 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  27.04 
 
 
483 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  28.8 
 
 
512 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  26.4 
 
 
386 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  28.49 
 
 
482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  27.6 
 
 
499 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  28.34 
 
 
484 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  27.39 
 
 
488 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  27.84 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  28.81 
 
 
519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  27.1 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  27.84 
 
 
506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  28.36 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  27.09 
 
 
480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  28.87 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  33.33 
 
 
401 aa  87  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  28.65 
 
 
355 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  29.84 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  30.21 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  24.66 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  27.84 
 
 
391 aa  66.6  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  30.73 
 
 
379 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  28.77 
 
 
345 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  29.66 
 
 
347 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  29.11 
 
 
344 aa  64.3  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  26.8 
 
 
367 aa  63.5  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  28.21 
 
 
340 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  27.47 
 
 
338 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  33.33 
 
 
406 aa  62.4  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  28.48 
 
 
342 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  28.67 
 
 
337 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  26.8 
 
 
352 aa  60.8  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  26.29 
 
 
338 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  28.37 
 
 
335 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  28.97 
 
 
348 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  41.25 
 
 
119 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  28.49 
 
 
384 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4187  porin  44.05 
 
 
107 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3035  hypothetical protein  38.75 
 
 
104 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3259  hypothetical protein  38.75 
 
 
102 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5547  hypothetical protein  32.23 
 
 
111 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  24.71 
 
 
390 aa  43.5  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>