33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4187 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4187  porin  100 
 
 		 107 aa  197  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  48.05 
 
 		 531 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5547  hypothetical protein  42.31 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  41.33 
 
 		 547 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  41.33 
 
 		 547 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  40.79 
 
 		 553 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  41.46 
 
 		 553 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  38.04 
 
 		 447 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3035  hypothetical protein  39.19 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  40.79 
 
 		 553 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  40.96 
 
 		 559 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3259  hypothetical protein  39.19 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  44.05 
 
 		 565 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  40.79 
 
 		 553 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  41.46 
 
 		 522 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  41.46 
 
 		 527 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  42.86 
 
 		 551 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  40 
 
 		 554 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  40 
 
 		 554 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  43.24 
 
 		 491 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  40 
 
 		 560 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  37.37 
 
 		 516 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  44.44 
 
 		 546 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  38.36 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  37.25 
 
 		 401 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  36.84 
 
 		 513 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  39.02 
 
 		 550 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  35.9 
 
 		 533 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4703  porin  79.31 
 
 		 44 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141107  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  30.47 
 
 		 529 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  31.25 
 
 		 491 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  32.08 
 
 		 495 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  32.11 
 
 		 499 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>