73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3186 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4437  porin  64.38 
 
 		 560 aa  661    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  96.56 
 
 		 553 aa  1065    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  75.85 
 
 		 559 aa  843    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  64.39 
 
 		 554 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  100 
 
 		 553 aa  1106    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  100 
 
 		 553 aa  1106    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  64.39 
 
 		 554 aa  676    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  56.97 
 
 		 527 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  55.6 
 
 		 547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  55.23 
 
 		 547 aa  581  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  56.08 
 
 		 522 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  55.94 
 
 		 550 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  56.74 
 
 		 553 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  54.39 
 
 		 551 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  52.93 
 
 		 533 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  54.94 
 
 		 491 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  53.14 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  52.57 
 
 		 546 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  48.24 
 
 		 565 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  33.62 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  32.75 
 
 		 561 aa  237  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  33.74 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  33.39 
 
 		 488 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  32.31 
 
 		 529 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  30.76 
 
 		 522 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  30.47 
 
 		 502 aa  176  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  29.34 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  30.92 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  28.62 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  29.85 
 
 		 497 aa  170  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  29.17 
 
 		 521 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  29.04 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  29.52 
 
 		 495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  28.4 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  32.18 
 
 		 447 aa  163  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  29.78 
 
 		 488 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  29.35 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  28.45 
 
 		 499 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  27.86 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  29.67 
 
 		 498 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  28.81 
 
 		 480 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  28.87 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  29.05 
 
 		 521 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  29.9 
 
 		 495 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  27.37 
 
 		 483 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  27.89 
 
 		 386 aa  143  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  27.7 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  37.04 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  31.68 
 
 		 372 aa  97.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  37.55 
 
 		 379 aa  93.6  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  36.3 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  35.14 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  38.24 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  35.79 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  34.76 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  36.02 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  34.22 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  33.12 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  30.6 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  29.59 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  32.62 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  40.74 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  28.03 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  43.04 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  41.77 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  32.37 
 
 		 348 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  32.93 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  68.75 
 
 		 347 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  37.78 
 
 		 119 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3259  hypothetical protein  38.96 
 
 		 102 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3035  hypothetical protein  38.96 
 
 		 104 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4187  porin  40.79 
 
 		 107 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  39.51 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>