46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3226 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  229  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3035  hypothetical protein  67.59 
 
 		 104 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3259  hypothetical protein  66.67 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  43.33 
 
 		 550 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5547  hypothetical protein  45.19 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  42.55 
 
 		 531 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  41.49 
 
 		 551 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  39.5 
 
 		 559 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  36.15 
 
 		 554 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  36.15 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  37.63 
 
 		 547 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  40 
 
 		 565 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  39.24 
 
 		 547 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  38.95 
 
 		 560 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  34.75 
 
 		 533 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  37.04 
 
 		 527 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  37.38 
 
 		 553 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  37.78 
 
 		 553 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  37.04 
 
 		 522 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  37.78 
 
 		 553 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  37.78 
 
 		 553 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  37.63 
 
 		 491 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  30.91 
 
 		 401 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  33.33 
 
 		 406 aa  50.1  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  33.33 
 
 		 546 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4187  porin  38.36 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  33.73 
 
 		 344 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  33.33 
 
 		 516 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  29.63 
 
 		 335 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  31.63 
 
 		 342 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  32.56 
 
 		 348 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  30.21 
 
 		 340 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  31.33 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  27.17 
 
 		 347 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  35.92 
 
 		 379 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  35.38 
 
 		 386 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  32.09 
 
 		 529 aa  43.5  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  53.12 
 
 		 355 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  37.68 
 
 		 372 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  46.51 
 
 		 391 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4030  hypothetical protein  50 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  33.73 
 
 		 372 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  30.19 
 
 		 495 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  44.19 
 
 		 367 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  38.1 
 
 		 384 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  30 
 
 		 345 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>