71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1139 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1139  porin  100 
 
 		 335 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  84.71 
 
 		 340 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  89.91 
 
 		 337 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  82.46 
 
 		 342 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  81.56 
 
 		 347 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  59.47 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  59.76 
 
 		 338 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  52 
 
 		 345 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  51.7 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  48.18 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  49.71 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  34.83 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  31.62 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  31.22 
 
 		 379 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  35.03 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  34.46 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  41.03 
 
 		 384 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  36.27 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  34.92 
 
 		 391 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  34.4 
 
 		 375 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  34.49 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  39.29 
 
 		 386 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  35.27 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  34.55 
 
 		 527 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  40.24 
 
 		 553 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  48.62 
 
 		 553 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  48.62 
 
 		 553 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  48.62 
 
 		 553 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  37.5 
 
 		 488 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  36.42 
 
 		 506 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  30.35 
 
 		 480 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  55.71 
 
 		 521 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  55.71 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  45.13 
 
 		 559 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  56.16 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  60.66 
 
 		 561 aa  83.2  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  33.04 
 
 		 495 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  41.07 
 
 		 506 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  39.68 
 
 		 502 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  58.57 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  56.16 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  35.15 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  36.14 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  54.29 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  42.61 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  58.46 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  31.31 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  51.56 
 
 		 533 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  32.76 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  54.41 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  32.33 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  41.07 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  34.71 
 
 		 531 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  43.64 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  35.15 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  27.93 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  34.59 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  34.59 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  33.55 
 
 		 560 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  77.42 
 
 		 516 aa  63.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  60 
 
 		 498 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  27.91 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  50 
 
 		 529 aa  59.7  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  30.26 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  34.58 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  33.64 
 
 		 547 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  28.65 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  65.52 
 
 		 513 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  29.58 
 
 		 119 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3259  hypothetical protein  28.21 
 
 		 102 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3035  hypothetical protein  25.93 
 
 		 104 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>