73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0264 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3381  porin  76.39 
 
 		 553 aa  849    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  100 
 
 		 559 aa  1115    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  62.89 
 
 		 560 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  62.55 
 
 		 554 aa  655    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  75.85 
 
 		 553 aa  841    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  75.85 
 
 		 553 aa  841    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  62.73 
 
 		 554 aa  656    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  55.89 
 
 		 547 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  55.18 
 
 		 547 aa  581  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  54.56 
 
 		 527 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  53.81 
 
 		 550 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  53.59 
 
 		 522 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  54.7 
 
 		 553 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  53.63 
 
 		 551 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  52.03 
 
 		 533 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  53.78 
 
 		 491 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  50.95 
 
 		 531 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  50.62 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  49.12 
 
 		 565 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  34.61 
 
 		 561 aa  258  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  32.41 
 
 		 516 aa  226  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  32.77 
 
 		 529 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  31.25 
 
 		 513 aa  214  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  32.17 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  31.86 
 
 		 522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  31.21 
 
 		 502 aa  170  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  29.4 
 
 		 482 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  29.85 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  30.81 
 
 		 491 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  30.31 
 
 		 506 aa  166  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  28.6 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  31.02 
 
 		 497 aa  165  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  29.64 
 
 		 488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  29.5 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  29.63 
 
 		 506 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  28.7 
 
 		 519 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  30.59 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  30.19 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  28.76 
 
 		 480 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  28.19 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  28.55 
 
 		 499 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  28.55 
 
 		 483 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  27.5 
 
 		 521 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  28.69 
 
 		 512 aa  143  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  27.31 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  28.52 
 
 		 521 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  29.91 
 
 		 498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  32.62 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  30.38 
 
 		 372 aa  94  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  34.67 
 
 		 379 aa  88.2  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  30.91 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  25.84 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  32.43 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  31.13 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  33.69 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  26.2 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  30.16 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  26.98 
 
 		 342 aa  67  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  25.85 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  30.27 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  28.88 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  27.78 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  27.31 
 
 		 340 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  31.93 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  41.98 
 
 		 335 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  30.94 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  61.76 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3035  hypothetical protein  35.29 
 
 		 104 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3259  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  57  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  26.65 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4187  porin  40.96 
 
 		 107 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  24.87 
 
 		 470 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>