71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1933 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  78.93 
 
 		 512 aa  806    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  100 
 
 		 522 aa  1049    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  68.39 
 
 		 497 aa  694    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  65.14 
 
 		 502 aa  636    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  70 
 
 		 506 aa  716    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  52.39 
 
 		 521 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  53.06 
 
 		 519 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  53.06 
 
 		 521 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  50.39 
 
 		 498 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  51.1 
 
 		 506 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  49.44 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  47.75 
 
 		 484 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  50.65 
 
 		 482 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  48.69 
 
 		 484 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  49.25 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  47.94 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  48.68 
 
 		 495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  48.69 
 
 		 498 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  47.96 
 
 		 483 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  46.46 
 
 		 499 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  34.83 
 
 		 527 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  34.23 
 
 		 522 aa  223  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  33.1 
 
 		 553 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  33.51 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  34.93 
 
 		 491 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  33.69 
 
 		 488 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  31.18 
 
 		 553 aa  187  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  30.99 
 
 		 550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  31.56 
 
 		 491 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  32.02 
 
 		 559 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  30.22 
 
 		 553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  30.22 
 
 		 553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  31.02 
 
 		 551 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  31.43 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  29.65 
 
 		 531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  29.26 
 
 		 546 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  30.69 
 
 		 516 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  29.09 
 
 		 554 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  29.09 
 
 		 554 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  29.71 
 
 		 560 aa  147  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  27.5 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  28.5 
 
 		 565 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  27.29 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  30.65 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  26.57 
 
 		 547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  28.35 
 
 		 529 aa  133  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  26.54 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  34.38 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  33.63 
 
 		 379 aa  101  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  30.7 
 
 		 406 aa  88.2  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  41.59 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  31.98 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  32.34 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  33.16 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  33.67 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  30.5 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  29.47 
 
 		 384 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  33.67 
 
 		 352 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  27.86 
 
 		 345 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  34.88 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  37.21 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  37.5 
 
 		 338 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  29.68 
 
 		 344 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  38.27 
 
 		 348 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  52.17 
 
 		 335 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  58.54 
 
 		 337 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  58.54 
 
 		 342 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  57.14 
 
 		 340 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  21.62 
 
 		 477 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2901  hypothetical protein  38.67 
 
 		 118 aa  47.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  22.85 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>