69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3326 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3326  porin  100 
 
 		 347 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  84.44 
 
 		 337 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  81.84 
 
 		 335 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  74.07 
 
 		 340 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  74.07 
 
 		 342 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  58.69 
 
 		 338 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  57.95 
 
 		 338 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  52.82 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  49.44 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  51.26 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  48.89 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  33.16 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  31.74 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  31.12 
 
 		 379 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  33.67 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  34.43 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  39.1 
 
 		 384 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  38.33 
 
 		 522 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  36.32 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  34.17 
 
 		 367 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  34.21 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  34.17 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  47.8 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  36.77 
 
 		 527 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  40.91 
 
 		 488 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  41.32 
 
 		 553 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  47.79 
 
 		 521 aa  92.8  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  40.36 
 
 		 482 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  45.45 
 
 		 519 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  44.55 
 
 		 521 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  34.52 
 
 		 480 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  42.19 
 
 		 502 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  44.64 
 
 		 506 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  32.23 
 
 		 553 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  45.13 
 
 		 512 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  44.55 
 
 		 497 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  44.35 
 
 		 553 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  36.9 
 
 		 506 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  44.35 
 
 		 553 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  43.36 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  51.85 
 
 		 561 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  34.09 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  36.36 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  34.26 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  31.15 
 
 		 559 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  39.76 
 
 		 546 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  42.11 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  42.37 
 
 		 498 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  33.04 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  28.1 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  37.58 
 
 		 484 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  33.52 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  43.48 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  30.85 
 
 		 529 aa  72.4  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  40.86 
 
 		 498 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  29 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  33.53 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  28.78 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  29.71 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  41.67 
 
 		 516 aa  69.3  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  31.58 
 
 		 554 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  31.58 
 
 		 554 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  30.14 
 
 		 560 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  31.58 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  33.33 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  32.46 
 
 		 547 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  35.42 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  28.65 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  26.83 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>