73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1479 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1479  porin  100 
 
 		 527 aa  1058    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  70.02 
 
 		 491 aa  697    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  87.76 
 
 		 522 aa  911    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  76.52 
 
 		 553 aa  794    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  61.71 
 
 		 546 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  57.35 
 
 		 553 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  57.3 
 
 		 553 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  57.3 
 
 		 553 aa  586  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  55.24 
 
 		 559 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  56.44 
 
 		 550 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  54.91 
 
 		 533 aa  548  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  55.3 
 
 		 551 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  55.41 
 
 		 560 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  53.97 
 
 		 554 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  53.79 
 
 		 554 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  55.31 
 
 		 531 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  48.57 
 
 		 547 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  47.86 
 
 		 547 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  50 
 
 		 565 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  35.68 
 
 		 561 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  34.48 
 
 		 516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  35.96 
 
 		 488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  34.15 
 
 		 529 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  33.22 
 
 		 513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  32.79 
 
 		 506 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  34.59 
 
 		 522 aa  224  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  33.09 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  32.97 
 
 		 497 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  32.46 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  31.71 
 
 		 480 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  31.73 
 
 		 491 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  31.78 
 
 		 498 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  31.54 
 
 		 482 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  33.86 
 
 		 488 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  31.97 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  31.12 
 
 		 512 aa  189  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  32.36 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  31.71 
 
 		 499 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  31.28 
 
 		 495 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  33.04 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  32.26 
 
 		 483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  30.04 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  30.65 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  30.72 
 
 		 519 aa  182  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  31.65 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  31.35 
 
 		 521 aa  173  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  28.33 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  38.76 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  33.1 
 
 		 372 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  39.15 
 
 		 379 aa  100  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  31.72 
 
 		 372 aa  95.1  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  31.01 
 
 		 375 aa  89.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  36.17 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  29.51 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  27.99 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  29.91 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  29.38 
 
 		 338 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  29.94 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  29.9 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  28.79 
 
 		 337 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  28.95 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  29.23 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  28.78 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  28 
 
 		 342 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  27.76 
 
 		 384 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  28.49 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  30.43 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  31.65 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  22.34 
 
 		 390 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  37.04 
 
 		 119 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3259  hypothetical protein  36.56 
 
 		 102 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3035  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4187  porin  41.46 
 
 		 107 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>