68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0637 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  100 
 
 		 367 aa  742    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  95.37 
 
 		 391 aa  672    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  82.4 
 
 		 375 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  70.3 
 
 		 355 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  61.5 
 
 		 372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  64.42 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  56.33 
 
 		 379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  47.67 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  38.23 
 
 		 406 aa  253  5.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  36.48 
 
 		 401 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  33.08 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  32.06 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  35.03 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  35.49 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  39.29 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  38.74 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  31.78 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  36.96 
 
 		 480 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  33.25 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  33.85 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  30.75 
 
 		 522 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  32.25 
 
 		 553 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  30.21 
 
 		 527 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  36.99 
 
 		 497 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  30.95 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  36.49 
 
 		 499 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  35.11 
 
 		 506 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  38.07 
 
 		 553 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  33.42 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  29.17 
 
 		 484 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  36.32 
 
 		 522 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  36.2 
 
 		 512 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  37.16 
 
 		 553 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  37.16 
 
 		 553 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  58.04 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  32.91 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  44.22 
 
 		 344 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  33.04 
 
 		 495 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  32.65 
 
 		 495 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  33.48 
 
 		 498 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  26.35 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  35.29 
 
 		 521 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  35.22 
 
 		 488 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  40.32 
 
 		 521 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  34.03 
 
 		 519 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  30.72 
 
 		 484 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  31.2 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  33.03 
 
 		 559 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  29.84 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  34.93 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  31.63 
 
 		 533 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  53.42 
 
 		 561 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  30.89 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  29.43 
 
 		 546 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  29.41 
 
 		 531 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  27.16 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  36.44 
 
 		 550 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  30.39 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  26.18 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  34.65 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  31.86 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  27.84 
 
 		 554 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  27.84 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  25.21 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  26.8 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  31.12 
 
 		 560 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  34.82 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  33.93 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>