69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0986 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0986  porin  100 
 
 		 337 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  84.5 
 
 		 342 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  89.91 
 
 		 335 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  83.04 
 
 		 340 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  83.57 
 
 		 347 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  59.94 
 
 		 338 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  59.18 
 
 		 338 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  52.29 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  48.46 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  51.7 
 
 		 348 aa  272  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  48.42 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  34.2 
 
 		 401 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  32.4 
 
 		 372 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  31.06 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  34.36 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  35.94 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  34.2 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  40.38 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  34.13 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  34.5 
 
 		 355 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  36.27 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  38.73 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  36.28 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  33.49 
 
 		 527 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  33.06 
 
 		 553 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  47.75 
 
 		 553 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  47.75 
 
 		 553 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  36.36 
 
 		 553 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  29.1 
 
 		 559 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  38.07 
 
 		 488 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  39.84 
 
 		 521 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  33.62 
 
 		 480 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  37.04 
 
 		 506 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  44.35 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  42.73 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  31.75 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  32.03 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  41.41 
 
 		 502 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  63.08 
 
 		 521 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  37.16 
 
 		 497 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  42.86 
 
 		 506 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  60.66 
 
 		 561 aa  82.4  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  33.48 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  60.29 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  36.69 
 
 		 546 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  31.53 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  27.37 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  41.23 
 
 		 488 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  33.78 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  31.63 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  54.41 
 
 		 498 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  34.09 
 
 		 531 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  32.14 
 
 		 554 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  32.06 
 
 		 560 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  32.14 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  27.59 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  43.64 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  41.82 
 
 		 551 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  33.48 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  38.71 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  31.06 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  77.42 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  28.16 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  43.94 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  31.78 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  30.84 
 
 		 547 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  29.61 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  65.52 
 
 		 513 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  31.51 
 
 		 119 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>