73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5088 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  72.46 
 
 		 531 aa  762    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  100 
 
 		 550 aa  1109    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  91.65 
 
 		 551 aa  996    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  56.01 
 
 		 553 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  55.94 
 
 		 553 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  55.94 
 
 		 553 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  54.14 
 
 		 559 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  56.48 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  56.14 
 
 		 527 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  57.12 
 
 		 565 aa  554  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  55.56 
 
 		 522 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  52.36 
 
 		 560 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  52.32 
 
 		 554 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  51.48 
 
 		 554 aa  534  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  52.04 
 
 		 533 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  54 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  49.47 
 
 		 546 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  48.85 
 
 		 547 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  48.5 
 
 		 547 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  35.28 
 
 		 561 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  35.64 
 
 		 529 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  34.81 
 
 		 516 aa  239  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  33.74 
 
 		 513 aa  227  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  33.22 
 
 		 488 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  29.92 
 
 		 522 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  32.4 
 
 		 519 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  32.22 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  31.57 
 
 		 502 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  30.63 
 
 		 498 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  30.57 
 
 		 484 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  30.14 
 
 		 495 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  31.29 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  30.82 
 
 		 491 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  32.77 
 
 		 482 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  31.24 
 
 		 480 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  29.41 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  31.66 
 
 		 521 aa  173  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  31.07 
 
 		 499 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  32.79 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  31.31 
 
 		 506 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  30.59 
 
 		 512 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  30.55 
 
 		 521 aa  170  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  31.63 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  31.12 
 
 		 483 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  29.54 
 
 		 495 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  31.46 
 
 		 498 aa  163  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  27.13 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  35.19 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  28.96 
 
 		 372 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  32.02 
 
 		 406 aa  96.7  9e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  37.33 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  35.57 
 
 		 355 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  29.94 
 
 		 375 aa  87  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  34.76 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  35.57 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  31.97 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  34.54 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  32.47 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  35 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  30.91 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  44 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  40 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  40 
 
 		 342 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  30.28 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  43.33 
 
 		 119 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  39.24 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  30.71 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  39.24 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  30.14 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3259  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3035  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4187  porin  39.02 
 
 		 107 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>