70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0664 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  100 
 
 		 512 aa  1030    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  79.5 
 
 		 522 aa  805    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  70.29 
 
 		 497 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  68.16 
 
 		 502 aa  670    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  68.65 
 
 		 506 aa  707    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  54.48 
 
 		 519 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  53.93 
 
 		 521 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  53.93 
 
 		 498 aa  505  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  52.24 
 
 		 521 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  51.23 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  50.38 
 
 		 488 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  48.94 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  48.65 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  49.43 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  49.13 
 
 		 482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  49.71 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  49.13 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  47.21 
 
 		 483 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  48.96 
 
 		 498 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  48.12 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  34 
 
 		 488 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  33 
 
 		 522 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  31.28 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  33.61 
 
 		 491 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  30.4 
 
 		 533 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  29.51 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  30.95 
 
 		 553 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  29.04 
 
 		 553 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  29.04 
 
 		 553 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  31.54 
 
 		 531 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  30.67 
 
 		 561 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  30.68 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  30.92 
 
 		 550 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  31.55 
 
 		 551 aa  163  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  31.36 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  29.82 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  28.63 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  29.15 
 
 		 559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  30.02 
 
 		 529 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  28.6 
 
 		 546 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  28.01 
 
 		 554 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  28.01 
 
 		 554 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  29.06 
 
 		 560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  29.14 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  26.14 
 
 		 547 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  25.76 
 
 		 547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  24.85 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  32.41 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  35.87 
 
 		 372 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  32.59 
 
 		 406 aa  97.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  36.93 
 
 		 401 aa  97.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  32.12 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  31.05 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  28.01 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  31.79 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  33.51 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  31.75 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  34.25 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  33.81 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  39.76 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  36.52 
 
 		 342 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  38.82 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  33 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  25.68 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  35.29 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  24.66 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  34.12 
 
 		 338 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  34.78 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  36.47 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  20.92 
 
 		 477 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>