68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0734 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0734  porin  100 
 
 		 561 aa  1112    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  56.12 
 
 		 516 aa  567  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  52.41 
 
 		 529 aa  555  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  51.87 
 
 		 513 aa  555  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  35.86 
 
 		 522 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  34.77 
 
 		 559 aa  264  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  34.65 
 
 		 533 aa  263  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  35.32 
 
 		 527 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  35.28 
 
 		 551 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  36.51 
 
 		 553 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  35.28 
 
 		 550 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  37.17 
 
 		 488 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  33.17 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  33.01 
 
 		 546 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  34.69 
 
 		 491 aa  232  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  33.55 
 
 		 531 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  33.28 
 
 		 565 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  31.63 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  31.63 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  32.53 
 
 		 495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  32.09 
 
 		 488 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  30.91 
 
 		 554 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  31.13 
 
 		 484 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  32.08 
 
 		 560 aa  210  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  32.33 
 
 		 491 aa  210  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  31.72 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  33.16 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  30.84 
 
 		 554 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  30.33 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  32.26 
 
 		 483 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  30.74 
 
 		 495 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  31.19 
 
 		 499 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  29.35 
 
 		 547 aa  191  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  29.51 
 
 		 547 aa  188  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  30.89 
 
 		 497 aa  188  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  31.62 
 
 		 519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  31.03 
 
 		 502 aa  180  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  31.18 
 
 		 506 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  31.81 
 
 		 522 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  30.63 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  31.02 
 
 		 512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  30.05 
 
 		 521 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  30.32 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  30.3 
 
 		 498 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  32.49 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  28.49 
 
 		 521 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  27.84 
 
 		 372 aa  86.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  52.56 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  27.82 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  59.02 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  25.36 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  44.62 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  61.54 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  58.97 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  64.71 
 
 		 352 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  49.02 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  55.26 
 
 		 347 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  55.26 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  53.85 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  61.76 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  61.76 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  52.17 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  29.88 
 
 		 384 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  58.82 
 
 		 345 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  47.83 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  61.11 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  61.11 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  50 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>