71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0447 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  100 
 
 
406 aa  835    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  41.97 
 
 
379 aa  323  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  41.97 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  42.05 
 
 
372 aa  299  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  40.81 
 
 
384 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  37.97 
 
 
355 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  36.73 
 
 
375 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  37.31 
 
 
391 aa  242  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  36.72 
 
 
367 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  27.57 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  36.63 
 
 
482 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  38.41 
 
 
480 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  32.59 
 
 
512 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  35.61 
 
 
488 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  34.5 
 
 
506 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  33 
 
 
495 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  37.2 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  35.38 
 
 
340 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  36.27 
 
 
335 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  36.27 
 
 
484 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  34.68 
 
 
345 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  31.11 
 
 
502 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  31.46 
 
 
488 aa  89.7  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  34.09 
 
 
352 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  34.36 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  33.5 
 
 
499 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  32.07 
 
 
506 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  34.84 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  35 
 
 
483 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  31.14 
 
 
522 aa  86.3  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  31.64 
 
 
497 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  36.25 
 
 
495 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  37.6 
 
 
521 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  36.27 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  33.14 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  27.8 
 
 
553 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  29.73 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  39.37 
 
 
521 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  30.54 
 
 
551 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  37.5 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  30.91 
 
 
559 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  30.88 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  33.17 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  33.33 
 
 
498 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  36.18 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  38.24 
 
 
553 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  30.52 
 
 
553 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  38.24 
 
 
553 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  29 
 
 
531 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  35.54 
 
 
519 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  29.29 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  29.91 
 
 
527 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  29.73 
 
 
522 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  29.24 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  36.67 
 
 
533 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  30.54 
 
 
491 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  27.62 
 
 
554 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  27.62 
 
 
554 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  41.84 
 
 
560 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  28.3 
 
 
546 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  44.62 
 
 
561 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  27.75 
 
 
516 aa  67.8  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  33.33 
 
 
565 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  25.16 
 
 
491 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  33.82 
 
 
547 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  34.29 
 
 
547 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  25.61 
 
 
529 aa  57  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  29.17 
 
 
513 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3259  hypothetical protein  28.95 
 
 
102 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3035  hypothetical protein  28.07 
 
 
104 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  32.98 
 
 
119 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>