69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4701 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  100 
 
 		 521 aa  1037    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  73.51 
 
 		 519 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  76.58 
 
 		 521 aa  758    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  63.15 
 
 		 498 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  55.05 
 
 		 506 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  56.98 
 
 		 506 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  56.82 
 
 		 482 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  55.01 
 
 		 480 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  57.71 
 
 		 497 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  54.73 
 
 		 483 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  54.36 
 
 		 484 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  53.69 
 
 		 488 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  53.93 
 
 		 512 aa  528  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  54.36 
 
 		 484 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  52.94 
 
 		 522 aa  519  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  55.6 
 
 		 502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  49.44 
 
 		 495 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  49.62 
 
 		 495 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  50.56 
 
 		 499 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  48.98 
 
 		 498 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  34.16 
 
 		 488 aa  208  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  30.8 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  32.35 
 
 		 553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  30.8 
 
 		 533 aa  192  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  31.16 
 
 		 527 aa  191  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  32.51 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  29.73 
 
 		 553 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  30.25 
 
 		 553 aa  177  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  30.25 
 
 		 553 aa  177  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  31.82 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  31.34 
 
 		 551 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  31.78 
 
 		 516 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  30.53 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  28 
 
 		 559 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  28.78 
 
 		 561 aa  158  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  30.12 
 
 		 513 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  28.88 
 
 		 491 aa  157  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  27.79 
 
 		 546 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  29.91 
 
 		 529 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  27.75 
 
 		 554 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  27.41 
 
 		 554 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  27.93 
 
 		 560 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  31.3 
 
 		 447 aa  134  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  28.94 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  26.88 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  26.69 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  28.86 
 
 		 386 aa  110  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  28.96 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  32.19 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  30.45 
 
 		 401 aa  99  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  30.67 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  28.51 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  27.11 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  32.28 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  28.44 
 
 		 372 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  27.62 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  28.57 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  32.98 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  28.1 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  39.76 
 
 		 347 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  36.47 
 
 		 338 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  36.47 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  45.21 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  47.83 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  33.73 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  46.51 
 
 		 335 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  57.14 
 
 		 337 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  28.83 
 
 		 348 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  28.83 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>