71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2221 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2221  porin  100 
 
 
372 aa  756    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  80.16 
 
 
372 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  69.07 
 
 
379 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  64.12 
 
 
375 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  58.67 
 
 
384 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  62.77 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  61.5 
 
 
367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  61.56 
 
 
391 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  41.97 
 
 
406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  35.77 
 
 
401 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  30.85 
 
 
340 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  31.39 
 
 
342 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  35.98 
 
 
482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  35.52 
 
 
488 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  33.45 
 
 
506 aa  119  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  33.33 
 
 
480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  32.77 
 
 
484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  32.4 
 
 
337 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  38.68 
 
 
506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  34.58 
 
 
502 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  32.97 
 
 
499 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  31.69 
 
 
497 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  32.06 
 
 
553 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  33.1 
 
 
527 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  33.44 
 
 
484 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  31.62 
 
 
335 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  26.83 
 
 
386 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  35.98 
 
 
498 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  36.45 
 
 
495 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  29.38 
 
 
522 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  31.99 
 
 
347 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  28.93 
 
 
483 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  32.48 
 
 
488 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  29.68 
 
 
522 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  30.33 
 
 
553 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  33.19 
 
 
447 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  36.45 
 
 
495 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  28.96 
 
 
521 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  35.87 
 
 
512 aa  99.8  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  31.68 
 
 
553 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  31.68 
 
 
553 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  32.07 
 
 
491 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  28.13 
 
 
519 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  28.41 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  29.77 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  42.4 
 
 
521 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  30.66 
 
 
546 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  41.04 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  28.91 
 
 
559 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  36.42 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  47.02 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  29.96 
 
 
516 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  46 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  29.39 
 
 
533 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  27.79 
 
 
551 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  28.57 
 
 
561 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  29.63 
 
 
531 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  29.49 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  29.49 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  28.96 
 
 
550 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  32.87 
 
 
491 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  31.58 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  28.16 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  27.54 
 
 
513 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  27.76 
 
 
560 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  29.68 
 
 
547 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  29.22 
 
 
547 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  24.66 
 
 
565 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  26.61 
 
 
477 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  33.59 
 
 
390 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  25.74 
 
 
560 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>