More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3127 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  76.96 
 
 		 218 aa  332  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  48.96 
 
 		 303 aa  167  9e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20420  predicted membrane protein  48.53 
 
 		 330 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  43.22 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  45.36 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  40.8 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  39.17 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  40.69 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  46.05 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  40.82 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  36.36 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  40 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  36.36 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  38.66 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  38.58 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  41.24 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  37.88 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  41.94 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  35.38 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  34.33 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  37.43 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  35.32 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  41.03 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  41.03 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  35.45 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  42.14 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  40.31 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  39.18 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  38.31 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  39.32 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  30.85 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  36.98 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  38.92 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  36.41 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  36.87 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  37.06 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  44.52 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  39.32 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  37.56 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  40.37 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  40.37 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  37.56 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  37.18 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1144  hypothetical protein  35.57 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.397537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  38.85 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  39.3 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  35.1 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  38.85 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  35.71 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  31.82 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  36.06 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  36.79 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  38.07 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  32.65 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  35.32 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  36.79 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  39.58 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  32.34 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  36.79 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  40.37 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  36.13 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  36.13 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  36.13 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  36.13 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  38.31 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  36.87 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  36.51 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0857  hypothetical protein  35.86 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  36.13 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  36.13 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  36.13 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  36.97 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  35.68 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  40.27 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  36.46 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  37.5 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  40.88 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  37.89 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  34.9 
 
 		 206 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  34.54 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  40.99 
 
 		 213 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  34.98 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  31.63 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  36.65 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1387  protein of unknown function UPF0126  37.93 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  40.21 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  34.9 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  34.52 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  39.13 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  31.63 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  39.13 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  35.2 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15050  predicted membrane protein  35.94 
 
 		 292 aa  96.3  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0337653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  34.46 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  36.98 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1850  hypothetical protein  35.96 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  37.11 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  35.38 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  34 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>