More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0604 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  391  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  68.18 
 
 		 206 aa  260  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  66.83 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  67.34 
 
 		 205 aa  254  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  66.83 
 
 		 206 aa  244  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  59.9 
 
 		 205 aa  240  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  59.39 
 
 		 205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  43.72 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  43.94 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  43 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  42.86 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  46.67 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  46.15 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  47.18 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  44.83 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  45.64 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  48.22 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  47.21 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  47.69 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  45.45 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  45.69 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  46.67 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  44.62 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  44.1 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  44.56 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  43.59 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  44.1 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  44.1 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  43.59 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  39.39 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  44.09 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  47.42 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  42.05 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  38.19 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  42.93 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  42.56 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  41.88 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  42.79 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  42.93 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  41.88 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  41.88 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  41.88 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  41.88 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  42.41 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  42.41 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  42.41 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  41.33 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  43.94 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  39.79 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  39.9 
 
 		 206 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  39.9 
 
 		 206 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  43.75 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  43.01 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  46 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  44.04 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  43.94 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  41.84 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  41.84 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  41.84 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  39.39 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  40.89 
 
 		 205 aa  134  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  39.39 
 
 		 204 aa  133  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  41.33 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  40.5 
 
 		 209 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  42.27 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  45.81 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  42.93 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  40.51 
 
 		 246 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  42.49 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  38.62 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  33.99 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  39.2 
 
 		 206 aa  131  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  45.27 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  45.27 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  47.53 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  40.82 
 
 		 231 aa  131  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  40.58 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  39.5 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  37.76 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1077  protein of unknown function UPF0126  43.39 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  39.8 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  39.8 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  39.8 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  43.88 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  41.97 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  40.29 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  38.62 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>