More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1842 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  89.62 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  89.62 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  66.18 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  52.88 
 
 		 211 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  51.92 
 
 		 211 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3918  hypothetical protein  66.16 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  52.97 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  54.68 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  49.04 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  53.85 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  48.79 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  48.79 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  46.12 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  49.51 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  48.21 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  48.74 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  48.98 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0760  hypothetical protein  46.35 
 
 		 197 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  37.5 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  41.24 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  41.84 
 
 		 206 aa  148  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  41.21 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  43.22 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  40.7 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  40.7 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  42.71 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  42.08 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  40.7 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  40.2 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  40.2 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  40.2 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  40.2 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  40.49 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  44.55 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  43.68 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  40.48 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0525  hypothetical protein  44.61 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  39.2 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  41.92 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0500  hypothetical protein  43.27 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  36.98 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  39.51 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  39.9 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  36.06 
 
 		 216 aa  138  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  38.78 
 
 		 206 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  41.54 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  35.38 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  39.39 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  36.06 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  36.06 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  36.06 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  36.06 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  39.7 
 
 		 208 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  36.51 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1175  hypothetical protein  44.16 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2223  hypothetical protein  42.44 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  37.95 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  35.98 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  35.45 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  37.69 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  36.1 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  35.45 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  35.45 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  35.45 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  41.58 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  39.3 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  43.08 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  43.08 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  43.08 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  43.08 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  43.08 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  43.08 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  43.08 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  43.08 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  42.05 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  43.08 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  38.61 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  35.15 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  40.62 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  36.41 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  41.75 
 
 		 207 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  36.51 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  36.51 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  38.04 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  39.41 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  38.04 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  36.22 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  40.62 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  41.86 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  42.14 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  42.14 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  41.54 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  43.12 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  41.54 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  41.54 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  41.54 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  41.54 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  40.34 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>