More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2647 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  414  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  53.54 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  47 
 
 		 222 aa  184  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  51.67 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  51.67 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  51.67 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  49.04 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  49.75 
 
 		 211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  52.17 
 
 		 251 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  51.76 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  51.96 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  52.28 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  50.24 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  46.84 
 
 		 211 aa  167  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  49.04 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  46.63 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  51.64 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  50.47 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  42.42 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  47.74 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  47.74 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  47.24 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  44.85 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  43.94 
 
 		 201 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  44.85 
 
 		 203 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  44.27 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  42.79 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  44.95 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  42.36 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  41.21 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  40.7 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  42.27 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  39.71 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  39.22 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  43.15 
 
 		 201 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  41.29 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  47 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1034  hypothetical protein  44.61 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.859571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  38.22 
 
 		 205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  38.95 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2327  hypothetical protein  44.61 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.814293  normal  0.0274448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  39.51 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  41.75 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  39.69 
 
 		 207 aa  131  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  39.9 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  38.94 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  41.75 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  44.9 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  42.21 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  44 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  38.19 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  41.24 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  39.8 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  39.5 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  37.62 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  42.56 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  40.21 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  39.51 
 
 		 207 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  35.82 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  39 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  39 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  39 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  39 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1387  protein of unknown function UPF0126  42.36 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  45.81 
 
 		 223 aa  121  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  39.06 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  33.5 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  38.61 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  36.18 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  34.9 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  36.71 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  35.68 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  36.54 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  33.5 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  38.39 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  33.94 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  36.23 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  37.07 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  37.37 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  35.68 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  38.58 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  38.58 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  41.41 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  41.84 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  32.81 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  41.8 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  30.93 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  32.02 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1077  protein of unknown function UPF0126  39.61 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  40.19 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  31.53 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  40.91 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  35.21 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  36.36 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  35.9 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  32.81 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  38.07 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>