More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3716 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  417  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  64.29 
 
 		 212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  65.22 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  65.22 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  65.22 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  60.87 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  53.89 
 
 		 211 aa  206  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  54.25 
 
 		 215 aa  187  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  55.77 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  50.98 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  44.22 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  45.41 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  45.5 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  44.5 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  44.04 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  42.29 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  41.67 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  45.05 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  44.16 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  44.61 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  44.12 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  44.12 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  41.67 
 
 		 206 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  42 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  45.7 
 
 		 201 aa  131  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  51.01 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  39.29 
 
 		 205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  41.87 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  44.27 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  40.88 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  40.25 
 
 		 205 aa  124  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  42.35 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  46.7 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  41.5 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  37.02 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  36.79 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2327  hypothetical protein  42.21 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.814293  normal  0.0274448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  43.43 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  38.34 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  41.07 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  42.93 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  35.03 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  39.09 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  40.1 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  39.69 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  40.5 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  40.5 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  40.5 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  42 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  40.5 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  39.38 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  39.6 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  40.25 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  35.68 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  39.11 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  37.19 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  36.57 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  38.46 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  34.38 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1034  hypothetical protein  42.77 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.859571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  37.76 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  38.89 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  33 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  34.52 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  33 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.27 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  34.31 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  35.38 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.16 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.16 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  39.01 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.16 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.16 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  33.82 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  33.82 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  37.63 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  38.81 
 
 		 206 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  38.12 
 
 		 211 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  36.79 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  38.81 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  37.13 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  39.61 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  37.81 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  37 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  37.63 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.16 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1850  hypothetical protein  34.95 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  34.01 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  31.94 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  37.91 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  36.92 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  33.71 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  36.45 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  32.45 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  34.52 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  36.82 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  41.46 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  28.71 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  33.67 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  33.67 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>