More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0767 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  76.21 
 
 
212 aa  278  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  65.22 
 
 
219 aa  235  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  51.81 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  55.66 
 
 
211 aa  185  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  51.67 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  51.76 
 
 
251 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  54.19 
 
 
210 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  45.1 
 
 
211 aa  151  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  46.12 
 
 
211 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  42.21 
 
 
209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  42.71 
 
 
201 aa  141  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  40.8 
 
 
203 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  43.22 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  42.49 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  39.34 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  39.51 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  44.72 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  44.1 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  39.11 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  41.5 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  44.04 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  40.39 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  43.52 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  40.5 
 
 
201 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  40.1 
 
 
206 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  47.74 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  39.09 
 
 
206 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  37.2 
 
 
205 aa  123  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  44.44 
 
 
216 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  42 
 
 
245 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  39.38 
 
 
218 aa  121  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  41.51 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2327  hypothetical protein  42.44 
 
 
208 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.814293  normal  0.0274448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  38.78 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  35.5 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  42.36 
 
 
203 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  45.73 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  32.31 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  41.18 
 
 
208 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  35.57 
 
 
204 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  43.72 
 
 
208 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  38.78 
 
 
208 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  34.38 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  37.24 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  39 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  36.1 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  38.27 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  38.78 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  38.42 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  37.76 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  40.99 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  36.73 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  38.78 
 
 
208 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  38.92 
 
 
206 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  37.56 
 
 
203 aa  111  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  40 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  37.76 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  35.11 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  38 
 
 
208 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  39.29 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  39.69 
 
 
216 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  46.95 
 
 
200 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  37.02 
 
 
211 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  44.24 
 
 
204 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  36.5 
 
 
206 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  39.52 
 
 
220 aa  105  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  36.36 
 
 
213 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  36.36 
 
 
213 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  36.36 
 
 
213 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  36.36 
 
 
213 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  40.67 
 
 
216 aa  104  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  36.75 
 
 
209 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  41.46 
 
 
219 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1077  protein of unknown function UPF0126  38.28 
 
 
215 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  41.67 
 
 
230 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  35.41 
 
 
217 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  35.71 
 
 
204 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  35.47 
 
 
209 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  37.5 
 
 
213 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  36.68 
 
 
213 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  34.24 
 
 
206 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  34.24 
 
 
206 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  32.5 
 
 
203 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  34.54 
 
 
210 aa  102  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  35.47 
 
 
207 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  35.47 
 
 
207 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  35.68 
 
 
209 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  35.68 
 
 
209 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  35.47 
 
 
207 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  35.47 
 
 
207 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  37.19 
 
 
213 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>