More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1723 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 203 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  49.25 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  49.25 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  48.74 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  49.75 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1034  hypothetical protein  48.97 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.859571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2327  hypothetical protein  46.63 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.814293  normal  0.0274448 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  43.98 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  41.29 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  42.5 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  43.16 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  42.5 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  42.5 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  48.76 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  44.9 
 
 		 231 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  38.07 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  47.5 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  46.5 
 
 		 212 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  38.02 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  46.39 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  44.39 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  38.95 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  36.84 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  35.79 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  35.79 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  41.03 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  36.84 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  43.56 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36.32 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  35.26 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  34.65 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  38.02 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36.32 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  34.16 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  41.71 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  36.55 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  33.85 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  37.44 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  35.79 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  41.71 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.84 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  36.04 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  41.41 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  36.73 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  37.19 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  38.71 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  39.06 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  34.41 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  35.68 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  34.27 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  42.41 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  38.38 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  34.76 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  41.67 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  33.84 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  32.82 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  41.18 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  34.72 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  36.1 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  31.18 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  38.15 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.67 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  31.96 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  35.11 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  31.41 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  33.16 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  30.46 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  38.02 
 
 		 222 aa  97.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  30.69 
 
 		 203 aa  97.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  34.01 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  35.11 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  36.98 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  35.6 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  37.18 
 
 		 246 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  35.11 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  37.44 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  30.26 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  37.95 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  35.78 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  32.64 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  30.3 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  30.3 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  33.71 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  31.96 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  36.68 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  32.29 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  38.95 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  39.15 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  36.98 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  31.69 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  41.5 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  32.79 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>