More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3420 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3420  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  377  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  65.48 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  65.48 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  64.97 
 
 		 208 aa  227  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1759  protein of unknown function UPF0126  63.45 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1034  hypothetical protein  60.2 
 
 		 207 aa  201  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.859571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  56.57 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  46.11 
 
 		 222 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  47.18 
 
 		 231 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  43.46 
 
 		 209 aa  157  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  46.77 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  48.76 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2327  hypothetical protein  44.9 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.814293  normal  0.0274448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  45.64 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1723  protein of unknown function UPF0126  46.39 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000275275  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  45.13 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  38.46 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  46.6 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  42.35 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  42.42 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  37.76 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  46.6 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  45.27 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  40.86 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  45.08 
 
 		 212 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  45.08 
 
 		 212 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  45.08 
 
 		 212 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  41.88 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  41.36 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  41.88 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  42.71 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  41.36 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  41.36 
 
 		 208 aa  131  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  40.84 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  42.41 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  36.46 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  39.06 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  40.31 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  39.27 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  39.06 
 
 		 205 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  39.39 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  42.64 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  34.9 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  41.36 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  41.36 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  41.36 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  39.27 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  41.36 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  34.67 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  34.69 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  39.27 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  39.9 
 
 		 206 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  38.38 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  39.9 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  31.5 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  36.46 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  36.6 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  35.94 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  32.99 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  39.13 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  39.13 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  45.81 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  35.82 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  39.8 
 
 		 213 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  37.17 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  35.38 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  34.2 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  43.22 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  37.7 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  42.29 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  40.31 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  33.16 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  35.32 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  39.59 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  39.01 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  35.26 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  36.68 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  36.79 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.74 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.74 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.74 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  36.41 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.74 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  38.46 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12810  predicted membrane protein  40.93 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  31.77 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  35.2 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  36.32 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  36.32 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  42.05 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  36.92 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  34.55 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  34.17 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  33.51 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  37.44 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  35.08 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  33.51 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  34.55 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>