More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4251 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  46.04 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  47.03 
 
 		 211 aa  188  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  46.53 
 
 		 208 aa  187  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  46.53 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  46.53 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  44.06 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  46.7 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  46.53 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  46.53 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  45.54 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  45.54 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  48.26 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  45.54 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  45.54 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  45.54 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  45.54 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  46.97 
 
 		 207 aa  181  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  46.04 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  45.5 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  48.5 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  48 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  47 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  42.44 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  47.52 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  47.52 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  47.52 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  44.61 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  48.5 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  48.5 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  48.5 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  48.5 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  48.5 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  48.5 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  48.5 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  48.5 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  47 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  43 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  47.76 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  48 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  46.97 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  46.97 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  46.97 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  46.97 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  46.97 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  40.39 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  47.92 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  42.29 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  47.06 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  37.13 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  40 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  42.35 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  37.44 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  37.95 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  37.95 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  37.95 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  37.95 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  40.31 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  37.44 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  41.24 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  37.44 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  37.44 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  37.44 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  36.95 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  38.07 
 
 		 203 aa  138  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  36.36 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  38.12 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  37.06 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  38.83 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  38.54 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  39.8 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  38.38 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  39.2 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  34.5 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  34.5 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  37.37 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  39.09 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  36.04 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  37.88 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  38.58 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  35.53 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  37 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  37.44 
 
 		 220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  41.71 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  35.86 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  36.87 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  35.03 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  38.27 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1171  hypothetical protein  41.58 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.534638  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2079  protein of unknown function UPF0126  39.3 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  36.04 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  39.51 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  37.95 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  34.98 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  34.98 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  37.44 
 
 		 206 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  35.38 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  33 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  34.16 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>