More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01709 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  63.46 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  40.39 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  35.38 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  39.79 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  34.3 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  37.95 
 
 		 207 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  38.39 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  34.69 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  32.37 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  37.13 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  31.88 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  34.47 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  33.5 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  31.88 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  35.64 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  37.11 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  32.66 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  32.85 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  35.15 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  33.17 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  32.85 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  32.85 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  32.99 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  32.52 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  32.85 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  35.41 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  40.1 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  38.46 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  38.46 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  38.46 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  38.46 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  38.46 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  38.05 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  35.2 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  31.88 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  37.44 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  37.44 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  37.44 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  36.9 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  36.59 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  33.79 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  40.91 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  40.26 
 
 		 209 aa  122  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  37.37 
 
 		 206 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  37.37 
 
 		 206 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  37.5 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  34.15 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  34.15 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  31.19 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  40.72 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  40.12 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  40.12 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  40.12 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  35.03 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  35.03 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  35.03 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  35.03 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  31.71 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  36.65 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  36.65 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  36.65 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  34.31 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  36.88 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  36.88 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  36.88 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  36.88 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4064  hypothetical protein  36.88 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  36.23 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  35.42 
 
 		 207 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  34.47 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  35.42 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  33.82 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  33.68 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  38.27 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  34.47 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  37.72 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  35.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  35.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4149  hypothetical protein  35.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.375876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  35.47 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  36.51 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  35.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  35.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  38.27 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  35.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  35.62 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  38.89 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  38.27 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>