More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1772 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  51.53 
 
 		 200 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  46.27 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  50.52 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  43.65 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  41.62 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  42.64 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  43.94 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  43.15 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  43.15 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  42.29 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  42.64 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  42.21 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  43.15 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  42.13 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  42.5 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  42.13 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  41.84 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  41.84 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  41 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  41.62 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  43.5 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  42.13 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  42.13 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  42.13 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  42.13 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  41.12 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  42.42 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  38.27 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  37.76 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  41.24 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  45.31 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  37.88 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  42.29 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  42.57 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  38.38 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  37.88 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  37.88 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  37.88 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  42.79 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  37.88 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  37.88 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  37.88 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  38.58 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  44.16 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  40.1 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0587  yadS protein  44.04 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  37.11 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  41.33 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  35.71 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  42.86 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  41.03 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  35.71 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  38.54 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  38.19 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  38.97 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  41.41 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  41.41 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  41.41 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  36.22 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  36.22 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  41.84 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  37.5 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  38.02 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  36.98 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  40.5 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  40.5 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  40.5 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  40.5 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  41.75 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  40.5 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  40.5 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  40.5 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  40.5 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  41.29 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  35.68 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  35.68 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  36.46 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  37.24 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  35.75 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  37.81 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  38.07 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  35.68 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  34.03 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  39.39 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  39.39 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  39.39 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  39.39 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  39.39 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  37.95 
 
 		 203 aa  131  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  38.07 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  34.52 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  31.68 
 
 		 222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  37.04 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  34.83 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  39.79 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  35.53 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  33.83 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  36 
 
 		 205 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  34.85 
 
 		 208 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>