More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1024 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 203 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  46.23 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  45.23 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  45.23 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  45.23 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  45.73 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  45.73 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  45.23 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  45.23 
 
 		 210 aa  178  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  44.22 
 
 		 210 aa  177  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  44.22 
 
 		 210 aa  177  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3937  hypothetical protein  44.72 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000127693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  37.88 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  40.61 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  40.61 
 
 		 208 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  40.61 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  40.1 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  40.61 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  40.61 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  40.61 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  40.61 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  40.61 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2180  hypothetical protein  41.26 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  38.58 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3364  protein of unknown function UPF0126  41.12 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  38.58 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  37.06 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  36.55 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  37.56 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  35.53 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  33.99 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.22 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  37.56 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  37.06 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  35.03 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  38.92 
 
 		 205 aa  130  9e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  38.31 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  39 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  35.75 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  39.02 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  39 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  35.5 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  35.32 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  36.46 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  37.44 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  34.18 
 
 		 246 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  35.86 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  35.82 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  36.22 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  37.63 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  40.59 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  33.82 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  35.47 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  33.67 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  33.67 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  37.37 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  38.42 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.54 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.54 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.54 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.54 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  36.27 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  37.93 
 
 		 213 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  39.13 
 
 		 221 aa  117  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  36.97 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  33.68 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  34.2 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  29.15 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  35.96 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  39.6 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  37.62 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  35.71 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  34.2 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  34.2 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  33.68 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  34.01 
 
 		 222 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  36.63 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  32.66 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  30.65 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  31.68 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  35.82 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  34.83 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  31.82 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  33.5 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  31.79 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  37.04 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  35.32 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  31.79 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  32.32 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  33.17 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  33.17 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  33.17 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.5 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  34.01 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  36.22 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  37.19 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  31.82 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  35 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  31.82 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  30.95 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>