More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00156 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  99.52 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  90.34 
 
 		 207 aa  374  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  96.14 
 
 		 207 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  96.14 
 
 		 207 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  96.14 
 
 		 207 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  96.14 
 
 		 207 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  96.14 
 
 		 207 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  86.27 
 
 		 204 aa  328  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  86.27 
 
 		 204 aa  328  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  86.27 
 
 		 204 aa  328  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  85.78 
 
 		 204 aa  324  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  65.69 
 
 		 203 aa  270  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  64.71 
 
 		 206 aa  260  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  66.5 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  64.71 
 
 		 206 aa  257  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  56.1 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  56.37 
 
 		 211 aa  228  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  55.67 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  55.67 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  54.68 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  55.67 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  54.68 
 
 		 208 aa  221  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  56.1 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  55.17 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  54.19 
 
 		 208 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  54.19 
 
 		 208 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  54.19 
 
 		 208 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  54.19 
 
 		 208 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  55.34 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  54.59 
 
 		 208 aa  215  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  54.11 
 
 		 208 aa  210  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  48.5 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  50.75 
 
 		 246 aa  175  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  49.05 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  52.53 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  44.88 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  45.27 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  48.26 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  39.51 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  39.51 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  37.95 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  41.36 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  45.96 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  41.36 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  41.36 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  44.56 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  35.82 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  37.44 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  40.5 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  37.95 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  41.18 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  38.74 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  40.48 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  40.48 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  39.22 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  39.02 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  39.09 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  38.42 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  38.42 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  38.42 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  38.61 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  37.86 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  37.38 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  40.5 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  39.09 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  40.7 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  36.89 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  36.89 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  36.89 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  36.89 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  42.23 
 
 		 206 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  38.35 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  44.61 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  40.61 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  41.71 
 
 		 238 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  36.95 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  42.64 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  38.38 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  39.23 
 
 		 222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_002950  PG0587  yadS protein  40.7 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  38.35 
 
 		 213 aa  128  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  37.61 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  36.68 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  40.31 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  35.15 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  40.84 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  32.34 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  43.08 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  41.18 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  34.95 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  37.88 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  37.13 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>