More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0263 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  81.31 
 
 		 206 aa  299  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  79.29 
 
 		 205 aa  298  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  77.34 
 
 		 206 aa  285  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  68.18 
 
 		 201 aa  278  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  57.65 
 
 		 205 aa  241  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  57.14 
 
 		 205 aa  240  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  47.98 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  41.41 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  46.15 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  41.71 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  45.92 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  46.94 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  47.45 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  44.66 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  39.29 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  44.67 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  43.94 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  43.08 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  44.33 
 
 		 211 aa  144  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  39.8 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  40.98 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  41.26 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  39.02 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  42.56 
 
 		 208 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  40.93 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  41.54 
 
 		 208 aa  140  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  38.34 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  41.54 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  38.14 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  44.55 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  42.86 
 
 		 214 aa  138  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  40.82 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  42.56 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  42.56 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  42.56 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  42.56 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  43.08 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  41.03 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  45.64 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  37.02 
 
 		 205 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  41.26 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  38.78 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  42 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  41.46 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  41.29 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  39.9 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  38.05 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  40.31 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  39.09 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  39.09 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  39.09 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  42.23 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  42.19 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  43.15 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  43.15 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  43.15 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  43.15 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  43.15 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  43.15 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  43.15 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  43.15 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0854  hypothetical protein  39.8 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.686804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  41.03 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  45 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  41.29 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  41.54 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  43.59 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  39.29 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  39.29 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  41.15 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  41.15 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  40.51 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  38.97 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  40 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  43.15 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  43.15 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  43.15 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  43.08 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  43.15 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  41.29 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  43.15 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  35.9 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  38.89 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  37.17 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  38.97 
 
 		 206 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  38.83 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  40.62 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  38.89 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  42.13 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  34.36 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  42.13 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  42.13 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  36.18 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  38.1 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>