More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0647 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
217 aa  432  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  37.13 
 
 
206 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  41.62 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  40.31 
 
 
208 aa  145  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  39.11 
 
 
207 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  39.8 
 
 
211 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  39.29 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  39.6 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  39.8 
 
 
207 aa  132  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  39.9 
 
 
206 aa  131  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  39.11 
 
 
206 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  39.29 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  39.8 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  38.83 
 
 
204 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  35.71 
 
 
218 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  35.9 
 
 
206 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  34.26 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  35.03 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  40 
 
 
206 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  34.83 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  34.83 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0225  hypothetical protein  39.6 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  35.05 
 
 
213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0242  hypothetical protein  39.6 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0244  hypothetical protein  39.6 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.127833  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  35.05 
 
 
213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0226  hypothetical protein  39.6 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0179127  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0228  hypothetical protein  39.6 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  35.05 
 
 
213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  35.05 
 
 
213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  33 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  34.31 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  40.31 
 
 
246 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  36.14 
 
 
215 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  33.82 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  33.82 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  38.61 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00156  conserved inner membrane protein  38.61 
 
 
207 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00155  hypothetical protein  38.61 
 
 
207 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0756868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3445  protein of unknown function UPF0126  38.61 
 
 
207 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2079  protein of unknown function UPF0126  36.28 
 
 
218 aa  115  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  36.36 
 
 
204 aa  115  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0162  hypothetical protein  38.61 
 
 
207 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0149  hypothetical protein  38.61 
 
 
207 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0161  hypothetical protein  38.61 
 
 
207 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  34.31 
 
 
216 aa  115  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0169  hypothetical protein  38.61 
 
 
207 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  41.58 
 
 
206 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3502  hypothetical protein  38.61 
 
 
207 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  37.44 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  33.5 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  34.18 
 
 
202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  39.04 
 
 
222 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3456  hypothetical protein  37.93 
 
 
204 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3327  hypothetical protein  37.93 
 
 
204 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0991  hypothetical protein  37.93 
 
 
204 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.612346  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  33.66 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  40 
 
 
208 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  36.41 
 
 
204 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  36.87 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  34.72 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  39.47 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  36.41 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  32.16 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  30.5 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  37.24 
 
 
207 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  38.38 
 
 
209 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  37.76 
 
 
207 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  35 
 
 
203 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  35 
 
 
203 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  35 
 
 
203 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  34.41 
 
 
218 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  34.41 
 
 
218 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  32.09 
 
 
206 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  32.09 
 
 
206 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  36.32 
 
 
209 aa  106  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  34.85 
 
 
206 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  33.8 
 
 
207 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  37.24 
 
 
207 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  37.19 
 
 
206 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  34.5 
 
 
203 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1171  hypothetical protein  36.1 
 
 
208 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.534638  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  29.9 
 
 
211 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  33.17 
 
 
205 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  33 
 
 
203 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  35.82 
 
 
202 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  36.22 
 
 
208 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  37.37 
 
 
203 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  36.9 
 
 
209 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.306176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>